在屏幕配置上，魅族16s采用了来自三星的6.2英寸Spuer Amoled屏，2232*1080的分辨率，对比度100000：1，最大亮度430nit。而在色彩，为例避免Amoled屏色彩过于艳丽的问题，魅族16s进行了专门的调教，观感上更加柔和舒适，同时在显示选项中提供四种模式供用户选择。

并且加入了通过了VDE认证的硬件级的蓝光过滤技术。另外为了解决Amoled在低亮度下PMW调光频闪的问题，魅族16s加入了软件DC调光，以减少频闪，总的来说在护眼方面魅族16s做的还算不错。屏下指纹模块方面，魅族16s采用的是汇顶科技最新的光学屏下指纹技术，官方宣称0.2秒解锁，从实际的体验来看，感觉并没有那么快，当然也有可能是因为有一个解锁过渡动画的原因，不过整个解锁的灵敏度成功率都还是比较不错的，另外还有了湿手解锁的能力，当你手上有汗或水的时候，指纹模块也是能识别和解锁的，当然速度和成功率会有些许下降。

魅族16s这块屏幕虽然算不上顶级的屏，但在一众旗舰级中也已经不落下风了，它的色彩调教，滤蓝光技术、软DC调光都在着力解决Amoled的痛点，包括屏下指纹模块也是业内比较不错的方案了。